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Tras cuatro años, Pokémon regresa a una portátil de Nintendo. Esta vez a Game Boy Color, máquina que, gracias a su potencial y su pantalla, consiguió mostrar el primer juego Pokémon en color. Nuestra aventura sucede en la región de Johto, donde tendremos que derrotar a los 8 líderes de gimnasio para conseguir sus medallas y vencer en la Liga Pokémon, para luego volver a un nuevo y mejorado Kanto, donde volveremos a enfrentarnos a las mismas aventuras que vivimos en Pokémon Rojo, Azul, Verde y Amarillo. La segunda generación Pokémon trae varias novedades y nuevos Pokémon.
Esta generación trae 100 nuevos Pokémon, que se añaden a los 151 de la 1º generación. Los Pokémon iniciales de Pokémon Oro y Plata (más conocidos como starters o novatos) son Cyndaquil (ヒノアラシ - Hinoarashi), el Pokémon ratón de fuego, Totodile (ワニノコ - Waninoko), el Pokémon fauces y Chikorita (チコリータ - Chikorīta), el Pokémon Hoja. Como siempre, tres Pokémon de tipo fuego, agua y planta respectivamente.
En cuanto a los Pokémon, también aparecieron dos nuevos tipos: Siniestro y Acero.
Una novedad destacada en estas nuevas ediciones es el reloj interno del Pokégear, un aparato del que hablaremos más adelante. Gracias a este reloj interno, se pudieron programar diferentes eventos a determinadas horas y días de la semana.
El Pokégear, a parte del reloj interno, tiene también las funciones de teléfono móvil, con el que podremos llamar a diferentes entrenadores que conozcamos durante nuestra aventura y el mapa, donde podremos ver el mapa completo de Johto y Kanto. Otra función del Pokégear es la radio, gracias a la cual podremos escuchar los programas que se emitan en Johto y Kanto.
  
También hay que destacar la aparición por primera vez de géneros en los Pokémon. Desde Pokémon Oro y Plata, los Pokémon tienen género masculino y femenino. Gracias a esto, podemos dejar dos Pokémon de diferente sexo en la guardería que tengan Huevos.
Aparecen nuevas Pokéballs gracias a los bonguris. Los bonguris se recogen de los árboles y hay diferentes tipos. Con cada tipo se puede contruir una Pokéball diferente. Para obtener una Pokéball de un bonguri hay que hablar con César, en Pueblo Azalea.
Por último, mencionar la división de "Especial" en " Ataque Especial" y " Defensa Especial" y la aparición de las bayas por primera vez.
 Los Pokémon Shiny
Los Pokémon Shiny son Pokémon especiales que tienen un color diferente al normal de su especie Pokémon. Al entrar en batalla con uno de ellos, aparecerá un brillo característico de este tipo de Pokémon. Es muy difícil que aparezca un Pokémon Shiny salvaje, las probabilidades son 1 entre 8192. Mediante la crianza, estas probabilidades aumentan puesto que la cría puede heredar las características de la madre o del padre.
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